民航联合研究基金由自然科学基金委和中国民用航空总局（以下简称民航总局）共同出资设立。该联合研究基金面向全国，旨在吸引国内高等院校、科研机构的科研人员参与以民用航空科技发展为背景的基础研究和应用基础研究，提升民用航空科技的源头创新能力，促进知识创新与科技创新的结合，为实现民航事业从大国走向强国的跨越做出贡献。

　　民航联合研究基金资助项目作为国家自然科学基金资助项目的组成部分，平均资助强度与当年的面上项目相近。项目由双方共同管理，申请、评审和管理严格按《国家自然科学基金面上项目管理办法》执行。鼓励开展国际合作交流及行业内外合作研究。申请过程中须注意以下几点：

1. 《项目指南》发布的鼓励研究领域内选择对民用航空科学技术发展具有重要意义的前瞻性、创新性基础项目；
2. 按照面上项目的管理办法（含限项规定）进行形式审查；
3. 申请采用国家自然科学基金申请书。在申请书的项目基本信息表中，资助类别选择联合资助基金项目，亚类说明选择面上项目，附注说明栏填写 民航联合研究基金。申请代码1一律选择“F01”，申请代码2按《指南》鼓励研究领域选择对应的代码。

　　联合基金每年总经费为400万。2005年度共资助23项联合基金申请（含小额探索研究3项）。近两年的申请情况表明了通过联合资助的方式，吸引国内高等院校、科研机构的科研人员参与以民用航空科技发展为背景的基础研究，是提升民用航空科技的源头创新能力和水平，培养民航科技人才的有效途径。值得提请申请者注意的是要进一步加强对民航领域科学和关键技术问题的凝练，注重创新性。

2006年主要资助如下领域的基础研究：

1. 与机场道面相关的新材料及岩土工程理论；飞机新材料、新工艺理论与技术；（申请代码2选择E01、E02、E03中的相应代码）
2. 新航行系统理论与技术；民航系统仿真技术；飞行性能理论与技术；（申请代码2选择F01和F03中的相应代码）；
3. 航空安全基础理论与技术；空中智能交通与信息安全；安全检查新理论与方法；突发事件应急决策系统；（申请代码2选择F01和F03中的相应代码）
4. 与民航设施有关的故障诊断；系统可靠性与系统安全性理论及方法；（申请代码2选择F01和F03中的相应代码）
5. 国家空域资源管理理论与方法；航空安全管理与航空犯罪预防控制理论；（申请代码2选择F03和G01中的相应代码）。